منذ إنشائها، وضعت كلية الطب بالجامعة الإسلامية نصب أعينها تحقيق الأهداف الآتية:
-
- تعليم وتدريب الطلاب والأطباء وباقي المختصين الصحيين في فلسطين في مجال الطب والعلوم الطبية.
- الارتقاء بالسلوك الصحي الوقائي في المجتمع الفلسطيني ونشر الثقافة الصحية في المجالات المختلفة.
- تقديم خدمات صحية نوعية في المستويات المتدرجة المختلفة من الرعاية الأولية حتى المتخصصة.
- تأسيس قاعدة قوية للبحث العلمي في قطاع غزة لإنتاج الأبحاث العلمية الأساسية والسريرية خدمةً للمواطن الفلسطيني وعملاً على نشر ثقافة البحث العلمي والتأليف والترجمة.
- تنمية قدرات الطلاب على التعلم الذاتي والتفكير التحليلي وحل المسائل.
- الاهتمام بالأمراض المحلية والبيئية في فلسطين والعمل على إيجاد الحلول المناسبة لها.
- تأهيل الأطباء والعاملين في المجال الصحي لأداء مهامهم على أكمل وجه.
- إعداد القيادات الصحية المتخصصة على مستوى عال للقيام بدورها في خدمة المجتمع.
- تقديم أفضل الخدمات الاستشارية في مجال الطب والعلوم الطبية.
- العمل بالتعاون مع كليات الطب الأخرى والجهات الطبية المعنية على توحيد المفاهيم الطبية ومعايير العمل الطبي في فلسطين لتكون مرجعاً للعاملين في هذا المجال للوصول إلى ممارسة طبية مهنية راقية.